Após as turbulências jurídicas do ano anterior, a CBF e o Clube dos 13 finalmente selaram um acordo em 1988. O Campeonato Brasileiro surgiu com uma proposta mais enxuta, contando com 24 equipes. O torneio passou a seguir as diretrizes de acesso e descenso recomendadas pela FIFA: os quatro piores times seriam rebaixados, enquanto os dois melhores da divisão inferior subiriam para a elite em 1989.
O certame também foi marcado por excentricidades do regulamento. Em caráter experimental, a vitória passou a valer três pontos. Contudo, a grande novidade era a decisão por pênaltis para todos os jogos que terminassem empatados. O vencedor garantia um ponto extra (somando dois no total), enquanto o perdedor ficava com apenas um. Foi nesse cenário que o Bahia veio para conquistar o bicampeonato.
Os 24 clubes foram divididos em dois grupos de 12, disputados em dois turnos. No primeiro turno, as equipes de uma chave jogaram contras as das outra. No Grupo B, o Tricolor de Aço iniciou em terceiro lugar, com cinco triunfos, cinco empates e duas derrotas. Somou 23 pontos (com três das penalidades).
No segundo turno, os confrontos ocorreram dentro dos próprios grupos. O Bahia manteve a regularidade, fechando a etapa em quarto lugar com seis triunfos, dois empates e três derrotas, somando 21 pontos. Como o Vasco liderou ambos os turnos, o regulamento previu o repasse das vagas. O Bahia, detentor da melhor campanha geral entre os não classificados diretamente, herdou a vaga e avançou.
O mata-mata, disputado já no início de 1989, revelou um Bahia pragmático e impulsionado por sua torcida apaixonada. Nas quartas de final, enfrentou o Sport. Após um 1 a 1 na Ilha do Retiro e um 0 a 0 na Fonte Nova (inclusive na prorrogação), o Bahia avançou por ter melhor pontuação acumulada.
Na semifinal, o adversário foi o Fluminense. Após segurar um empate sem gols no Maracanã, o Bahia protagonizou um momento histórico em Salvador. Diante de mais de 110 mil pessoas (o recorde de público da Fonte Nova), o Tricolor de Aço ganhou por 2 a 1 de virada, com dois gols de Bobô, garantindo a vaga na final contra o Internacional, que superou Cruzeiro e Grêmio.
A decisão colocou frente a frente o Internacional com a raça do Bahia liderado por Bobô, Charles e Paulo Rodrigues, comandados por Evaristo de Macedo. No jogo de ida, na Fonte Nova, o Internacional saiu na frente, mas os tricolores demonstraram seu poder de reação e viraram para 2 a 1 com dois gols de Bobô. Com a vantagem do empate, o Tricolor de Aço viajou até o Beira-Rio e montou uma defensa intransponível. O placar de 0 a 0 foi o suficiente para coroar o Bahia como bicampeão brasileiro.






