O primeiro semestre de 2001 foi memorável para o Flamengo. Após sagrar-se tricampeão carioca diante do Vasco, com o antológico gol de falta de Petkovic, o clube garantiu sua vaga na Copa dos Campeões, torneio sediado em Maceió e João Pessoa. O regulamento da competição manteve-se quase idêntico ao ano de sua estreia, com o grande atrativo de oferecer uma vaga na Libertadores. O torneio preenchia, com sucesso, o hiato existente no calendário brasileiro da época: aquele período de entressafra entre o fim dos campeonatos estaduais, em junho, e o início do Brasileirão, em agosto.
A fase preliminar reuniu os campeões do Centro-Oeste e do Norte, além do vice do Nordeste, resultando nas classificações de São Raimundo-AM e Sport, que deixaram o Goiás pelo caminho. O mata-mata principal começou em seguida, e o rubro-negro cruzou com o Bahia, campeão do Nordeste. A vitória por 4 a 2 no jogo de ida deixou a situação encaminhada para o Mengão, que confirmou a superioridade ao vencer novamente no confronto de volta, desta vez por 2 a 0, sem dar chances ao adversário.
Na semifinal, o desafio foi contra o Cruzeiro, campeão da Copa Sul-Minas. O empate sem gols na partida de ida trouxe alguma preocupação, fazendo crer que o confronto seria decidido nos detalhes. Contudo, no segundo jogo, o Flamengo descomplicou a história: com uma atuação dominante, aplicou um 3 a 0 categórico e carimbou sua vaga na final. O oponente na decisão seria o São Paulo, campeão do Torneio Rio-São Paulo, que avançou após eliminar Sport e Coritiba.
A principal alteração em relação à edição de 2000 ocorreu justamente no formato da final, que deixou de ser em partida única para ser disputada em jogos de ida e volta. O primeiro embate aconteceu no Almeidão, em João Pessoa. O Flamengo começou de forma avassaladora, construindo uma vantagem de 3 a 1 ainda no primeiro tempo. O São Paulo, contudo, não se entregou e reagiu, forçando os cariocas a manterem a postura ofensiva até o apito final. O duelo terminou com a vitória rubro-negra por 5 a 3.
Quem imaginou que o segundo jogo seria mais tranquilo no Estádio Rei Pelé, em Maceió, acabou se enganando redondamente: a rede continuou balançando freneticamente para ambos os lados. Os paulistas tentaram reverter a desvantagem e chegaram a sair na frente, mas sofreram a virada flamenguista na etapa final. O São Paulo ainda buscou forças para virar o marcador novamente nos instantes derradeiros, vencendo o confronto por 3 a 2. Contudo, com o placar agregado de 8 a 6, o Flamengo sagrou-se campeão, conquistando seu primeiro e único título da Copa dos Campeões e, com ele, a cobiçada passagem para a Libertadores de 2002.






